四年一班的十堂堤馬、柚木理和神山美思是學校「懸疑推理學會」的成員，
柚木理是本書的主角；十堂堤馬熱愛推理，曾運用推理能力幫老師解決學校的謎團；神山美思是運動全能的女生，也是柚木理的青梅竹馬。三人受到老師的委託便會出動查案！
一天晚上，有人把金魚放進了學校的泳池引起混亂，令同學們無法上游泳課！究竟是誰，又為了什麼這樣做？真理子老師委託「懸疑推理學會」偵查這次事件，三人藉着祭典活動在學校附近搜查，美思和阿理按照堤馬的推理，找到了令人驚訝的情報，而這些看似與金魚泳池無關的情報原來是破案的關鍵——？