本書由《馬端肅公奏議》《馬端肅公三記》《馬端肅公詩集》三部分組成，基本將馬文升的詩文搜羅齊備。 又有二種附錄——《馬文升詩文輯補》《明人所撰馬文升詩序輯補》。 其中《馬端肅公奏議》以明嘉靖二十六年葛洞邗江書館校正刊刻本為底本，以明崇禎十一年平露堂刻《皇明經世文編》節錄本《馬端肅公奏疏》、天津師範大學圖書館藏清初刻本《馬端肅公奏議》、浙江圖書館藏清刻本《馬端肅公奏議》、國家圖書館藏《四庫全書》底本《馬端肅公奏議》、《四庫全書》本《端肅奏議》為參校本; 《馬端肅公三記》以明嘉靖二十九年至三十年袁氏嘉趣堂刻《金聲玉振集》本《馬端肅公三記》為底本，以萬曆四十五年沈節甫輯、陳於廷刊《紀錄彙編》本《馬端肅公三記》為參校本; 《馬端肅公詩集》以南京圖書館藏明萬曆十八年馬悫刻本為底本。