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你是我不曾忘記，卻沒有勇氣想起的秘密。

如果殘酷真的都已經被埋葬在過去，

如果我只需要珍惜現在與未來，

為什麼心裡，卻仍然像是缺了一塊……

這個夏天，少年恭平與天才物理學家湯川學都過得十分不平靜。來到玻璃浦姑姑家經營的「綠岩莊」過暑假的恭平，以及因為工作關係來到此地的湯川，萬萬沒想到才剛抵達這個純樸的海岸小鎮，便隨即被捲入一起死亡事件。

同住在旅館的另一名旅客，被人發現陳屍在海邊的岩石區，死者生前曾是名能力卓越的刑警，更因為十六年前偵辦的一起殺人案件與玻璃浦產生淵源，單純的失足意外無法說服警視廳高層，案情因此陷入膠著。

而總是對案件毫不關心，也不喜歡人際應對的湯川，卻反常地讓恭平跟在身邊，不但教他寫暑假作業，甚至還不合常理地要他幫忙偷東西。

即使對湯川的要求充滿疑惑，但恭平並不想違抗他，總覺得只要和這個博士在一起，就能遇上意想不到的事。直到恭平漸漸發現，博士好像在秘密進行著某個計畫，而那背後似乎藏著會讓他不想知道的真相……